序一序二序三序四凡例十六则劝医六则七方论十剂论辟陶隐居十剂内增入寒热二剂论辟缪仲醇十剂内增升降二剂论卷之一（宫集）人参黄芪甘草白术苍术熟地生地当归牛膝远志石菖蒲卷之二（商集）天门冬麦门冬五味子菟丝子甘
金匮玉函要略方论序金匮要略序（出赵本．）金匮玉函要略综概卷一脏腑经络先后病脉证第一（论十三首、脉证三条）湿病脉证第二（论一首、脉证十二条、方十一首）百合狐惑阴阳毒病证治第三（论一首、证三条、方十二首）
尚论篇
卷上太阳方总论卷下阳明方总论少阳方总论太阴方总论少阴方总论厥阴方总论六经方余论
走马急疳真方
治法总论用药歌血头行走穴道歌左右论药中禁忌穴名药名全身门第一头面门第二身中门第三脊背门第四腿足门第五金创门第六杖伤附通用门第七跌损妙方书后谨跋
序一序二备急灸法屈指量法例诸发等证肠痈疔疮附骨疽皮肤中毒风卒暴心痛转胞小便不通霍乱霍乱转筋风牙疼精魅鬼神所淫夜魇不寤卒忤死法溺水自缢急喉痹鼻衄妇人难生小肠气一切蛇伤治犬咬治狂犬所咬点灸法下火法用火法候
黄帝素问灵枢叙自序卷一 刺法九针十二原一小针解二九针论三官针四终始五官能六卷二 刺法刺节真邪七逆顺八行针九血络论十论勇十一论痛十二五邪十三五乱十四五禁十五玉版十六师传十七外揣十八禁服十九卷三 经络经脉
吴序张序自序张声驰序卷上人身一小天地论阴阳互根论五行生克论阴阳治法大要论枢机论卫气行度一经星经天论营气行度一经水行地论百病提纲论望病须察神气论卷中闻声须察阴阳论问证求病论切脉源流论内伤大要论湿气论卷下
序（前）弁首序凡例卷之一脉诀脉学大要脉体捷法诸脉相类止脉分人迎气口脉诀内因脉外因脉不内不外因脉死绝脉动止脉诸脉宜忌类验诸死证脉归空十法病机杂病赋病机赋病机抄略卷之二药性药性赋运气五运主病六气主病中风附