吴序张序自序张声驰序卷上人身一小天地论阴阳互根论五行生克论阴阳治法大要论枢机论卫气行度一经星经天论营气行度一经水行地论百病提纲论望病须察神气论卷中闻声须察阴阳论问证求病论切脉源流论内伤大要论湿气论卷下
叙卷上伤寒论难读并宜补大旨三阳三阴分经名义伤寒重病多是下焦伏寒伏寒触发与伤寒时温脉证并病机异同即病伏气直中传经四证异同晚发是伤寒正病两感有三水气凌心即是三焦伤伤寒杂病皆有之无端暴喘即是寒入命门伤寒杂病
序一序二卷一运气（上）太极图论阴阳体象五行生成数解五行统论每日气数百刻六千分解四季日躔宿度昼夜长短刻数二十四气七十二候斗纲解十二辰次六合解二十八宿过宫歌二十八宿说中星岁差考奎壁角轸天地之门户说气数统论
第1部分第2部分第3部分第4部分
难经本义
《滇南本草》序一《滇南本草》抄本跋《滇南本草》抄本后序重刊《滇南本草》序《滇南本草》序二第一卷石莲花木贼贯众七星草石苇白果松节、松笔头、松香、地盘松球侧柏叶玉兰花野棉花云连白芍、赤芍牡丹皮鸡头实荷叶藕
编写说明导言一、干支配属（一）天干的阴阳五行属性与方位（二）天干配属脏腑经络与五季（三）天干配属五运（四）地支纪月与所属四季（五）地支所属阴阳五行（六）地支配合时间与脏腑经络二、年、月、日、时干支掌上
序录上序录下解毒服药忌食药不宜入汤酒者上石类上草木类上虫兽类玉石上品玉石中品玉石下品草木上品草木中品草木下品虫兽上品虫兽中品虫兽下品玉石三品玉石上品玉屑玉泉丹砂水银空青曾青白青扁青石胆云母朴硝硝石矾石
原序序卷之一麻疹骨髓赋（增朴）静远主人麻疹西江月（删订）麻证条目法旨用药要诀（删订）增订治麻问答捷要麻疹形式要旨证治秘诀麻疹证治大略括密斋治法大略括验麻色吉凶麻疹轻证麻疹重证麻疹不治证麻疹死证括应用药
十二经补泻温凉引经药歌